自动化您的合成生物学工作流程
使用 QPix 自动化您的人工合成生物学工作流程
菌株工程等高通量合成生物学应用将大大受益于机器人控制型微生物克隆筛选系统生产率的提高，比如我们的 QPix® 微生物克隆筛选系统，该系统凭借自动拣选运行数据跟踪和数据库管理功能可实现每天拣选多达 30,000 个克隆。QPix 系统可集成到端到端分子工作流程中，使用户能够获得更高的通量并能离开更长时间，从而有更多机会专注于 DBTL 方法的学习部分，为新菌株的后续设计提供信息。
工作流程：采用 QPix 的合成生物学
- 铺板： 平板接种是合成生物学研究的第一步，即将微生物细胞或基因结构涂布到固体琼脂平板上以形成单个克隆。为了简化此过程，可采用机械克隆接种仪等自动化系统。这些系统使用高密度阵列技术，能够以精确、高效的方式同时对大量样品进行平板接种。这种自动化可节省时间并降低人为错误的可能性，从而使研究人员能够在更短的时间内对更多样品进行平板接种。
- 筛选： 平板接种后，下一步是筛选克隆以确定目标克隆。传统上，这一直是手动完成的步骤，研究人员根据某些特征目视检查并选择克隆。但为了提高通量，自动化克隆筛选系统变得越来越受欢迎。这些系统采用成像分析和机器学习算法，可根据预定义标准快速确定克隆并对其进行分类。对此过程进行自动化可快速筛选大量克隆，从而节省时间并降低主观性。
- 拣选： 确认目标克隆后，则开始拣选过程。传统上，此步骤一直依赖于手动技术，例如使用无菌移液器吸头、牙签或接种环。但采用自动化微生物克隆筛选系统可提高通量。这些先进的系统采用带有细吸头或针头的机械臂，将选定的克隆精确、快速地转移到各种下游应用中。自动化微生物克隆筛选系统每小时可处理大量样品，从而显著增加通量并减少费力型任务。
- 在合成生物学中使用自动克隆挑选系统的一些好处：
- 可实现更高的通量，同时尽量减少人力劳动
- 可提供一致且客观的克隆挑选，而不是主观的人工挑选
- 可适应各种不同的应用
- 电子数据追踪允许进行有据可查的数据控制
- 复制： 复制选定克隆是合成生物学研究的关键步骤，能够保存和分配遗传物质，以便进行进一步的分析和实验。手动复制需要通过划线法将克隆接种到多个平板上，这样既耗时又容易出现人为错误。使用自动化克隆复制系统可简化此过程。这些系统采用机械技术和高密度阵列技术，可同时将克隆复制到多个平板上，从而确保一致性和效率。
- 基因重新排列： 基因重新排列需要将克隆从原板转移到新形式或容器中，以便进行长期储存或其他实验。此步骤对于保留大量遗传资源和促进高通量工作流程至关重要。自动化基因重新排列系统（如带有条形码读取器和液体处理功能的机械微生物克隆筛选系统）可以准确、有效地将克隆转移到不同形式的装置（如微孔板或存储管）中。通过自动化基因重新排列，研究人员可以实现标准化和无错误的转移过程，从而更好地组织和获取遗传资源。